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我國“合成生物學(xué)”急需研究哪些問題?

時(shí)間:2011-09-26     來源:科學(xué)時(shí)報(bào)
總體來說,發(fā)展合成生物學(xué)的目標(biāo)和目的應(yīng)該包括國家在材料、能源、化工產(chǎn)品方面的重大需求,逐漸減少對石油的依賴。發(fā)展一個(gè)逐漸可以與化工過程競爭的工業(yè)生物產(chǎn)業(yè)?!  ?/p>


  《科學(xué)時(shí)報(bào)》:目前合成生物學(xué)研究面臨的主要挑戰(zhàn)是什么? 


  陳國強(qiáng):有很多挑戰(zhàn),最大的挑戰(zhàn)也許是新生命的合成。如何合成出一個(gè)有新特征的生命?對于工程應(yīng)用領(lǐng)域來說,重要的是合成出一條新的代謝路徑,獲得野生微生物不能合成的產(chǎn)物。為此,要全面了解微生物的調(diào)控機(jī)制。比如說,把相關(guān)基因拼到一起(或合成)之后,可能會(huì)合成出一個(gè)微生物的代謝通路,但是它沒有按照預(yù)期目標(biāo)去大量合成所需要的產(chǎn)物。因?yàn)樵诩?xì)胞里面,有大量基因參與調(diào)控,如果不清楚它的功能,把它精簡掉之后就會(huì)出問題,得不到我們希望的產(chǎn)物??傊?,細(xì)胞沒有按照所需要的方向發(fā)展。所以這些調(diào)控的東西影響了我們隨心所欲地設(shè)計(jì)某種生物的企圖。如果知道了所有的調(diào)控的機(jī)制,挑戰(zhàn)就小了許多。不過,還有另一個(gè)挑戰(zhàn)是,如果設(shè)計(jì)出來的生物體控制不住怎么辦? 


  《科學(xué)時(shí)報(bào)》:國際上對合成生物學(xué)研究主要集中在哪些方面? 


  陳國強(qiáng):可能最令人矚目的是具有新功能的新生命的合成吧。這主要是滿足人類的好奇心。其他的主要集中在工程和應(yīng)用。第一個(gè)方面就是所謂最小基因組的研究。一般來說,基因組越小,細(xì)胞生長得越快。其原理主要是DNA合成和代謝負(fù)擔(dān)減少了。最小基因組研究就是通過有目的刪除多余基因,獲得在特定條件下有優(yōu)勢的簡化基因組微生物?!?/p>


  另外就是合成路徑的研究。在最小基因組研究的基礎(chǔ)上,用各種基因組成的元件拼裝成某種產(chǎn)物的合成代謝路徑??梢允且粭l利用二氧化碳光合作用合成氫氣的代謝路徑,可以是一條合成紫杉醇的代謝路徑……有無窮無盡的可能性,使這個(gè)細(xì)胞在滿足生長的最低要求后,集中精力去生產(chǎn)你需要的產(chǎn)品?!?/p>


  第三,就是模塊化研究。就是把各種功能的基因模塊化,等到需要的時(shí)候把各個(gè)功能模塊組裝起來就可以了。像積木玩具一樣,通過不同的組合,變成房子、汽車、飛機(jī)等不同的東西。 


  《科學(xué)時(shí)報(bào)》:我國開展合成生物學(xué)研究、發(fā)展合成生物學(xué)的目的是什么?針對國家什么樣的重大需求? 


  陳國強(qiáng):我國是一個(gè)資源消耗大國,在材料、能源、化工產(chǎn)品的消耗量方面等都居世界第一位,所以,我國開展合成生物學(xué)的目標(biāo)就應(yīng)該包括解決材料、能源、化工產(chǎn)品的重大需求。因此,發(fā)展合成生物學(xué)的主要目的應(yīng)該包括逐漸減少對石油的依賴,利用農(nóng)業(yè)生物質(zhì)如纖維素、非糧淀粉、非糧脂肪酸等為原料生產(chǎn)材料、能源、化工產(chǎn)品等??傮w來說,發(fā)展合成生物學(xué)的目標(biāo)和目的應(yīng)該包括國家在材料、能源、化工產(chǎn)品方面的重大需求,逐漸減少對石油的依賴。發(fā)展一個(gè)逐漸可以與化工過程競爭的工業(yè)生物產(chǎn)業(yè)。當(dāng)然,合成生物學(xué)的研究也將產(chǎn)生許多研究生命活動(dòng)的重大科學(xué)問題?!?/p>


  《科學(xué)時(shí)報(bào)》:不少國家都發(fā)布了合成生物學(xué)路線圖,我國也在制定過程中,您認(rèn)為作為路線圖應(yīng)強(qiáng)調(diào)哪些問題? 


  陳國強(qiáng):我認(rèn)為未來合成生物學(xué)要利用系統(tǒng)生物學(xué)的方法研究微生物——主要是細(xì)菌的工業(yè)應(yīng)用,使微生物最大程度地生產(chǎn)工業(yè)產(chǎn)品包括材料、精細(xì)化工產(chǎn)品和生物燃料等。利用合成生物學(xué)的手段構(gòu)建(合成)新的微生物,能夠最優(yōu)地進(jìn)行工業(yè)發(fā)酵。最終的目的是實(shí)現(xiàn)復(fù)合功能微生物的構(gòu)建。 


  《科學(xué)時(shí)報(bào)》:您長期從事PHA材料方面的研究,合成生物學(xué)為這一領(lǐng)域注入哪些新內(nèi)容?會(huì)產(chǎn)生哪些變革? 


  陳國強(qiáng):PHA的合成需要微生物的高速生長和PHA的大量積累來實(shí)現(xiàn),這也是降低PHA生產(chǎn)成本的關(guān)鍵。所以,如何構(gòu)建最小基因組的微生物來實(shí)現(xiàn)上述目的,是我們實(shí)驗(yàn)室重要的研究方向。通過基因組、轉(zhuǎn)錄組、蛋白質(zhì)組和代謝組以及代謝流量組的全盤研究,尋找與PHA合成關(guān)系不大、對細(xì)菌生長不是必要的基因進(jìn)行刪除,獲得能高速生長和大量積累PHA、從碳源到PHA轉(zhuǎn)化率高的最小基因組微生物。